Na agropecuária, os microrganismos podem ser utilizados em uma ampla gama de aplicações. Exercem papel importante na substituição parcial ou total de fertilizantes químicos, como promotores de crescimento de plantas e como agentes de controle biológico de pragas, doenças e plantas daninhas, impactando diretamente o desenvolvimento das plantas e a produção de alimentos na nutrição e saúde animal, na produção de probióticos, e no desenvolvimento de vacinas e de métodos de diagnóstico de doenças, no processamento e armazenamento de alimentos e em diversas outras aplicações, como biorremediadores de resíduos, além de servirem como fonte de genes para a biotecnologia. Créditos Embrapa.