Os antagonistas são microrganismos que possuem potencial para interferir no crescimento ou na sobrevivência dos patógenos diretamente, contribuindo, desse modo, para o controle biológico. Podem ser: residentes, ou habitantes naturais do solo, superfície e/ou interior dos vegetais, ou em qualquer sítio que possa ser ocupado pelo patógeno. Podem ser multiplicados em laboratório e, então, reintroduzidos no ambiente, para potencializar sua ação; não residentes, ou microrganismos exóticos, ou isolados de outros ambientes ecológicos e que podem ser cultivados e aplicados aos sítios onde são necessários (no solo, nas sementes, atomizados sobre as folhas e outros órgãos das plantas, ou misturados aos substratos).
Certos antagonistas apresentam ação de supressão de patógenos que atacam os frutos em pós-colheitas, sendo aplicados diretamente na superfície de frutos, raízes e tubérculos colhidos. Créditos Embrapa.