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Como uma praga é qualquer organismo que seja nocivo e possa causar danos a uma planta cultivada e seus produtos, as análises realizadas são específicas para cada grupo de pragas, organizadas em sete laboratórios (ácaros, insetos, plantas infestantes, fungos, nematoides, bactérias, vírus). Ou seja, são feitos exames com a ajuda de lupas buscando organismos maiores como insetos, ácaros e sementes de plantas infestantes. Nas plantas cultivadas em quarentenários, é realizada uma busca de sintomas de possíveis pragas que só aparecem no decorrer do crescimento/desenvolvimento da planta. Métodos de diagnóstico que utilizam meios de cultura, sorologia e análise molecular (DNA) podem também ser utilizados para a interceptação e a identificação das pragas. Créditos Embrapa.

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