Sim, e é denominada conservação de espécies-alvo. Nesse caso, a conservação de espécies complementa a conservação de ecossistemas por meio da proteção de grupos (plantas e animais) de interesse ou importância particular. Esta se dá, por exemplo, quando tratamos dos esforços de conservação de espécies ameaçadas de extinção, por causa da intensa exploração ou ameaça aos seus indivíduos (como o palmito na Mata Atlântica ou o mogno na Floresta Amazônica); da destruição dos habitats preferenciais de algumas espécies (como no caso das florestas, para a onça-pintada ou o mico-leão-dourado); ou ainda, quando tratamos das espécies consideradas chaves para a manutenção da funcionalidade (da saúde) dos ecossistemas (como o caso de algumas espécies de palmeiras na Amazônia ou das barrigudas nas florestas secas, que são fundamentais para a produção de alimentos para a fauna em períodos de escassez de alimentos).