A caracterização bioquímica reside na possibilidade de se observar as atividades metabólicas dos microrganismos. São as chamadas provas bioquímicas, pelas quais se observam as transformações químicas verificadas em determinado substrato. Essas transformações são decorrentes de reações catalisadas por enzimas, utilizando nutrientes obtidos do ambiente que os cercam. Como um determinado microrganismo, ou grupo de microrganismos, possui sistemas enzimáticos específicos, as transformações bioquímicas são específicas e, portanto, constituindo características próprias. Um exemplo é a capacidade de usarem enzimas para degradar hidratos de carbono, lipídeos, proteínas e aminoácidos. Geralmente, a metabolização dessas moléculas gera produtos, cuja detecção pode ajudar na caracterização dos organismos de interesse. Créditos Embrapa.