Em todas as coleções de germoplasma, é necessária uma infraestrutura básica para recepção, conferência e armazenamento das amostras, além de suporte administrativo e gerencial. É importante, também, dispor de uma área para triagem e processamento do material biológico/germoplasma, bem como um laboratório para manipulação e realização de análises de viabilidade e qualidade do material. Logo, para conservação ex situ, cada coleção necessita de equipamentos e infraestrutura específica condizentes com a natureza do germoplasma a ser conservado, foco principal de uma coleção e/ou banco. Consideram-se infraestruturas necessárias para a conservação ex situ em cada área específica de recursos genéticos:
• Vegetal: câmaras climatizadas, casa de vegetação, telados, criotanques, freezer, além de estruturas de apoio, como laboratórios, cabines de fluxo laminar, câmara de secagem e galpão.
• Animal: criotanques e ultrafreezer -80 °C. Para os casos que necessitem de avaliação do material conservado, é necessário contar com uma estrutura de laboratório contendo microscópio, estereomicroscópio e banho-maria.
• Microrganismos: refrigeradores, ultrafreezer (-80 °C), liofilizador, cabines de fluxo laminar dependendo do nível de segurança biológica requerido, tanques de nitrogênio, termociclador, área de preparo de meios de cultura, lavagem e esterilização, área para manipulação e processamento de material genético. Créditos Embrapa.